Dr. Roland Krause
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| Faculty or Centre | Luxembourg Centre for Systems Biomedicine | ||||||||
| Department | Bioinformatics Core | ||||||||
| Postal Address |
Université du Luxembourg 2, Avenue de l'Université L-4365 Esch-sur-Alzette |
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| Telephone | (+352) 46 66 44 6267 | ||||||||
| Fax | (+352) 46 66 44 36267 | ||||||||
| Social Media & Blogs | |||||||||
| Speaks | English, French, German | ||||||||
| Research Stays in | Germany, Luxembourg, USA | ||||||||
Postdoc in the Bioinformatics Core group (R. Schneider Lab)
Last updated on: Wednesday, 02 September 2015
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In press
Gene selection for optimal prediction of cell position in tissues from single-cell transcriptomics; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Life Science Alliance (in press)
2021
Climate change and epilepsy: Insights from clinical and basic science studies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsy and Behavior (2021), 116
Ultra-rare constrained missense variants in the epilepsies: Shared and specific enrichment patterns in neuronal gene-sets 2021.04.18.440264; ; ; ; ; ; ;
E-print/Working paper (2021)
Loss of function variants in the KCNQ5 gene are associated with genetic generalized epilepsies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
E-print/Working paper (2021)
Modeling seizures in the Human Phenotype Ontology according to contemporary ILAE concepts makes big phenotypic data tractable; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia (2021), n/a(n/a),
Sub-genic intolerance, ClinVar, and the epilepsies: A whole-exome sequencing study of 29,165 individuals; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in The American Journal of Human Genetics (2021)
Role of Common Genetic Variants for Drug-Resistance to Specific Anti-Seizure Medications; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Frontiers in Pharmacology (2021), 12
Assessing the role of rare genetic variants in drug-resistant, non-lesional focal epilepsy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Annals of Clinical and Translational Neurology (2021), n/a(n/a),
2020
Semantic Similarity Analysis Reveals Robust Gene-Disease Relationships in Developmental and Epileptic Encephalopathies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in The American Journal of Human Genetics (2020), 107(4), 683-697
Ten simple rules for making training materials FAIR.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in PLoS computational biology (2020), 16(5), 1007854
A framework to assess the quality and impact of bioinformatics training across ELIXIR.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in PLoS computational biology (2020), 16(7), 1007976
Predicting functional effects of missense variants in voltage-gated sodium and calcium channels; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Science Translational Medicine (2020), 12(556), 6848
The Human Phenotype Ontology in 2021.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nucleic acids research (2020)
Gene family information facilitates variant interpretation and identification of disease-associated genes in neurodevelopmental disorders; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Genome Medicine (2020), 12(28),
Testing association of rare genetic variants with resistance to three common antiseizure medications; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia (2020), 61(n/a), 657-666
Pharmacoresponse in genetic generalized epilepsy: a genome-wide association study; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Pharmacogenomics (2020), 0(0),
2019
A genome-wide association study of sodium levels and drug metabolism in an epilepsy cohort treated with carbamazepine and oxcarbazepine; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia Open (2019)
Ultra-Rare Genetic Variation in the Epilepsies: A Whole-Exome Sequencing Study of 17,606 Individuals; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in American Journal of Human Genetics (2019)
Genomic and clinical predictors of lacosamide response in refractory epilepsies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia Open (2019), 0(0),
A Recurrent Missense Variant in AP2M1 Impairs Clathrin-Mediated Endocytosis and Causes Developmental and Epileptic Encephalopathy.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in American journal of human genetics (2019)
Intestinal-Cell Kinase and Juvenile Myoclonic Epilepsy.; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in New England Journal of Medicine (2019), 380(16), 24
Comparative effectiveness of antiepileptic drugs in juvenile myoclonic epilepsy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia Open (2019), 0(0),
2018
Exome-wide analysis of mutational burden in patients with typical and atypical Rolandic Epilepsy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in European Journal of Human Genetics (2018)
Rare gene deletions in genetic generalized and Rolandic epilepsies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in PLoS ONE (2018)
Rare coding variants in genes encoding GABAA receptors in genetic generalised epilepsies: an exome-based case-control study; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Lancet Neurology (2018), 17(8), 699-708
Genome-wide mega-analysis identifies 16 loci and highlights diverse biological mechanisms in the common epilepsies;
in Nature Communications (2018)
Personalized risk prediction of postoperative cognitive impairment - rationale for the EU-funded BioCog project.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in European Psychiatry (2018), 50
2017
Application of rare variant transmission disequilibrium tests to epileptic encephalopathy trio sequence data; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in European Journal of Human Genetics (2017)
Comparative effectiveness of antiepileptic drugs in patients with mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia (2017)
De Novo Mutations in Synaptic Transmission Genes Including DNM1 Cause Epileptic Encephalopathies.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in American Journal of Human Genetics (2017), 100(1), 179-
A systems level analysis of epileptogenesis-associated proteome alterations.; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Neurobiology of disease (2017), 105
Genetic variation in CFH predicts phenytoin-induced maculopapular exanthema in European-descent patients.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Neurology (2017)
Rare GABRA3 variants are associated with epileptic seizures, encephalopathy and dysmorphic features; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Brain : A Journal of Neurology (2017), 140(11), 2879-2894
Alterations in the α2δ ligand, thrombospondin-1, in a rat model of spontaneous absence epilepsy and in patients with idiopathic/genetic generalized epilepsies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsia (2017)
2016
Crowdsourced estimation of cognitive decline and resilience in Alzheimer's disease; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Alzheimer's and Dementia: the Journal of the Alzheimer's Association (2016), 12(6), 645-653
The Human Phenotype Ontology in 2017; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nucleic Acids Research (2016)
Evaluation of Presumably Disease Causing SCN1A Variants in a Cohort of Common Epilepsy Syndromes; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in PLoS ONE (2016)
70S-scanning initiation is a novel and frequent initiation mode of ribosomal translation in bacteria.; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2016), 113(9), 1180-9
2015
Biomarkers of postoperative delirium and cognitive dysfunction; ; ;
in Frontiers in Aging Neuroscience (2015), 7(112),
CHD2 variants are a risk factor for photosensitivity in epilepsy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Brain: a Journal of Neurology (2015)
Investigation of GRIN2A in common epilepsy phenotypes.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Epilepsy research (2015), 115
The phenotypic spectrum of SCN8A encephalopathy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Neurology (2015), 84(5), 480-489
De novo loss- or gain-of-function mutations in KCNA2 cause epileptic encephalopathy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nature Genetics (2015), 47(4), 393-9
CHD2 myoclonic encephalopathy is frequently associated with self-induced seizures; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Neurology (2015), 84(9), 951-958
2014
De Novo Mutations in Synaptic Transmission Genes Including DNM1 Cause Epileptic Encephalopathies; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in American Journal of Human Genetics (2014), 4
De novo mutations in HCN1 cause early infantile epileptic encephalopathy; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nature Genetics (2014)
Mutations in STX1B, encoding a presynaptic protein, cause fever-associated epilepsy syndromes; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nature Genetics (2014), 46(12), 1327-32
2012
Exploring biological interaction networks with tailored weighted quasi-bicliques.; ; ;
in BMC Bioinformatics (2012), 13 Suppl 10
2011
Selecting oligonucleotide probes for whole-genome tiling arrays with a cross-hybridization potential.; ;
in IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (2011), 8(6), 1642-52
The plexus model for the inference of ancestral multidomain proteins.; ;
in IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (2011), 8(4), 890-901
2010
Live Coverage of Intelligent Systems for Molecular Biology; ; ; ; ; ;
in PLoS Computational Biology (2010), 6
Live Coverage of Scientific Conferences Using Web Technologies; ; ; ; ; ;
in PLoS Computational Biology (2010), 6(1), 1-2
2008
Mutation in the transcriptional regulator PhoP contributes to avirulence of Mycobacterium tuberculosis H37Ra strain.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Cell Host and Microbe (2008), 3(2), 97-103
2007
Identifying protein complexes directly from high-throughput TAP data with Markov random fields.; ; ;
in BMC Bioinformatics (2007), 8
2006
Identifying protein complexes in high-throughput protein interaction screens using an infinite latent feature model.; ; ;
in Pacific Symposium on Biocomputing (2006)
2004
Shared components of protein complexes--versatile building blocks or biochemical artefacts?; ; ;
in BioEssays (2004), 26(12), 1333-43
2003
A comprehensive set of protein complexes in yeast: mining large scale protein-protein interaction screens.; ;
in Bioinformatics (2003), 19(15), 1901-8
2002
Functional organization of the yeast proteome by systematic analysis of protein complexes.; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
in Nature (2002), 415(6868), 141-7
